尖裸鲤病变死亡后微生物群落结构变化分析

陈美群; 李宝海; 周建设; 潘瑛子; 扎西拉姆; 王万良; 《西南农业学报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：【目的】本文探讨了尖裸鲤因水霉菌病变死亡后的微生物群落结构变化特征。【方法】采用Illumina-Miseq高通量测序技术对尖裸鲤健康个体和因水霉菌病变死亡个体的表皮皮肤粘液及肠道内容物的微生物多样性进行分析。【结果】尖裸鲤因水霉菌病变死亡后其表皮皮肤和肠道中细菌群落多样性减少,而其真菌多样性增加。尖裸鲤病变死亡后其表皮皮肤粘液中Pseudomonas sp.、Vagococcus sp.、Providencia sp.、Morganella sp.、Pleosporales、Mucorales、Tremellales和Agaricomycetes等8种优势微生物菌群减少,而Acinetobacter sp.、Proteus sp.、Carnobacterium sp.和Malassezia sp.等4种优势微生物菌群增加。同时,尖裸鲤病变死亡后其肠道中Acinetobacter sp.、Flavobacterium sp.、Vagococcus sp.、Carnobacterium sp.、Bacillus sp.和Malassezia sp.等6种优势微生物菌群减少,而Pseudomonas sp.、Tremellales和Agaricomycetes等3种优势微生物菌群增加。【结论】细菌和真菌的群落结构变化是尖裸鲤病变死亡的主要原因。

关键词： 高通量测序 尖裸鲤 微生物群落 水霉病