科研产出
西藏那曲地区不同年龄段牦牛的腹泻微生物群落特征及病原学分析
《甘肃畜牧兽医 》 2025
摘要：本研究聚焦西藏那曲地区牦牛，深入探究其不同年龄段的腹泻样本中微生物群落分布特征。通过采集西藏那曲部分乡镇散养的不同年龄段（犊牛、犊青年牛、青年牛、成年牛）临床严重腹泻牦牛的粪便样本20份，经初步处理后提取总核酸，运用宏基因组二代测序（mNGS）技术进行分析，揭示微生物群落的分布规律。结果显示，不同年龄段牦牛中各菌属呈现出不同的分布特点；20份腹泻样本中共检出病毒、细菌、血原虫病和支原体等46种病原。结合当前国内外牦牛养殖中已报道和流行的病原，与宏基因组检测的20份临床病例样品的检测结果进行比对，筛查出细菌14种、病毒3种，以及支原体、血原虫等其他病原6种，共计23种主要诱发牦牛腹泻的病原；结合当地临床经验和已发表的部分研究结果，从mNGS鉴定出的病原中综合筛选出9种导致西藏那曲牦牛腹泻的病原，包括5种细菌（埃希氏菌属、肉毒梭菌、巴氏杆菌属、李斯特菌属和嗜血杆菌属）、2种病毒（黄病毒科和冠状病毒科）及2种寄生虫（吸虫和绦虫）。本研究首次系统分析西藏那曲地区不同年龄段牦牛腹泻样本微生物群落，结合当地临床经验精准筛选致泻病原，为当地牦牛疫病防控提供针对性依据。
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藏北一年生人工草地弃耕不同年限的土壤微生物群落特征研究
《中国草地学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：探讨人工草地弃耕对高寒草甸土壤微生物群落的影响,可为藏北高寒草地生态保护提供理论参考.分别采集弃耕2年、弃耕10年的人工草地和天然草地表层(0~10 cm)土壤样品,采用高通量测序技术分析土壤微生物群落组成和多样性变化.结果表明:土壤细菌群落独有OTUs表现为天然草地(5416)>弃耕2年(5057)>弃耕10年(3933),真菌群落独有OTUs表现为弃耕10年(1638)>弃耕2年(1564)>天然草地(1266).不同弃耕年限土壤微生物群落多样性无显著差异.细菌群落(门和属水平)组成的主要影响因子为土壤pH值、有机质含量和速效氮含量,真菌群落门水平主要影响因子为土壤速效氮含量、pH值、速效磷含量和有机质含量,属水平主要影响因子除上述因子外还包括速效钾含量.总之,微生物群落组成与土壤因子密切相关.
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病死黑斑原鮡表皮和肠道微生物群落研究
《安徽农业科学 》 2018
摘要：[目的]了解病死黑斑原鮡表皮和肠道微生物群落的变化及其与黑斑原鮡死亡的关系。[方法]利用新一代高通量测序技术,研究病死黑斑原鮡表皮皮肤黏液和肠道内容物微生物群落的变化及其对黑斑原鮡死亡的影响。[结果]黑斑原鮡病变死亡后,肠道中Acinetobacter sp.、Flavobacterium sp.、Vagococcus sp.、Carnobacterium sp.、Bacillus sp.和Malassezia sp.6种优势微生物菌群减少,而Pseudomonas sp.、Tremellales和Agaricomycetes 3种优势微生物菌群增加;黑斑原鮡病变死亡后其表皮皮肤黏液中Pseudomonas sp.、Vagococcus sp.、Providencia sp.、Morganella sp.、Pleosporales、Mucorales、Tremellales和Agaricomycetes 8种优势微生物菌群减少,而Acinetobacter sp.、Proteus sp.、Carnobacterium sp.和Malassezia sp.4种优势微生物菌群增加。[结论]细菌和真菌在黑斑原鮡表皮和肠道中菌群的变化,可能是导致黑斑原鮡病变死亡的主要原因之一。
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尖裸鲤病变死亡后微生物群落结构变化分析
《西南农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本文探讨了尖裸鲤因水霉菌病变死亡后的微生物群落结构变化特征。【方法】采用Illumina-Miseq高通量测序技术对尖裸鲤健康个体和因水霉菌病变死亡个体的表皮皮肤粘液及肠道内容物的微生物多样性进行分析。【结果】尖裸鲤因水霉菌病变死亡后其表皮皮肤和肠道中细菌群落多样性减少,而其真菌多样性增加。尖裸鲤病变死亡后其表皮皮肤粘液中Pseudomonas sp.、Vagococcus sp.、Providencia sp.、Morganella sp.、Pleosporales、Mucorales、Tremellales和Agaricomycetes等8种优势微生物菌群减少,而Acinetobacter sp.、Proteus sp.、Carnobacterium sp.和Malassezia sp.等4种优势微生物菌群增加。同时,尖裸鲤病变死亡后其肠道中Acinetobacter sp.、Flavobacterium sp.、Vagococcus sp.、Carnobacterium sp.、Bacillus sp.和Malassezia sp.等6种优势微生物菌群减少,而Pseudomonas sp.、Tremellales和Agaricomycetes等3种优势微生物菌群增加。【结论】细菌和真菌的群落结构变化是尖裸鲤病变死亡的主要原因。
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