科研产出
色瓦绵羊RPL8基因的组织表达特征及生物信息学分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究色瓦绵羊核糖体蛋白L8基因（RPL8）在各组织部位的表达特征及其潜在功能作用，揭示RPL8基因调控色瓦绵羊产奶质量的分子作用机制，为推进色瓦绵羊的分子遗传育种提供理论依据。【方法】PCR扩增色瓦绵羊RPL8基因，通过ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0等在线软件分析RPL8基因结构特征及潜在功能，并以实时荧光定量PCR检测其在色瓦绵羊各组织中的表达分布情况。【结果】RPL8基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、脾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等9个组织中均有表达，在小肠、乳腺和卵巢中的相对表达量极显著高于其他组织中的相对表达量（P＜0.01）。色瓦绵羊RPL8基因编码区（CDS）序列长774 bp，共编码257个氨基酸残基；基于RPL8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示，色瓦绵羊与山羊、牦牛、牛等反刍物种的亲缘关系较近。色瓦绵羊RPL8蛋白相对分子量为28024.66Da，理论等电点（pI）为11.04，是一种稳定的碱性亲水性蛋白，不具有跨膜结构，主要定位于细胞质（占78.3%）；色瓦绵羊RPL8蛋白存在15个磷酸化位点[7个丝氨酸（S）位点，8个苏氨酸（T）位点]，其二、三级结构中均以无规则卷曲为主。色瓦绵羊RPL8蛋白的互作蛋白均为核糖体蛋白，其同源性高达99.90%，其中，RPS5、RPS16、RPL11、RPS3、RPS18和RPS11属于通用核糖体蛋白家族，RPL13属于真核核糖体蛋白家族。【结论】色瓦绵羊RPL8是一种胞内稳定的碱性亲水性蛋白，具有核糖体蛋白的基本结构特征。RPL8基因在色瓦绵羊各组织中的表达具有普遍性，尤其在乳腺和卵巢中呈高表达，说明RPL8基因除了发挥其家族基本功能作用外，在色瓦绵羊乳腺和卵巢组织中可能还影响乳脂含量与卵泡的周期性发育。
关键词： 色瓦绵羊 核糖体蛋白 RPL8基因 乳腺 卵巢 组织表达特征
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产双羔及单羔彭波半细毛羊发情期卵巢中的差异表达蛋白
《应用与环境生物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：绵羊的产羔性状研究对于提升绵羊繁育力至关重要,彭波半细毛羊作为西藏第一个国家级绵羊新品种,对其产双羔的机制研究能够有力推动藏系绵羊的人工繁育工作.采用基于TMT标记的定量蛋白质组学方法,对发情期产双羔彭波半细毛羊卵巢的特异表达蛋白和调控机制进行系统研究.共检测到6 446种彭波半细毛羊卵巢蛋白,其中双羔组有116种蛋白相比单羔组出现了上调表达,171种蛋白出现了下调表达.通过对差异表达蛋白的功能分析,发现产双羔绵羊卵巢中蛋白的表达合成及运输等生物过程显著增强,同时细胞的增殖、运动及信号转导等生理活动也更加活跃.另一方面,产双羔绵羊卵巢中的脂肪酸降解、脂类代谢、氨基酸等小分子化合物的降解和代谢明显下降.此外,产双羔绵羊卵巢细胞中的糖酵解活动有所增强,而三羧酸循环有所减弱.上述结果表明产双羔彭波半细毛羊卵巢内的蛋白表达调控机制能满足更强的卵泡发育和排卵活动需求,从而促进卵泡的发育及成熟卵子的排出;一些有机小分子催化酶出现了明显的特异表达,作为其底物的小分子有机物可以作为产双羔的潜在标志物进行更深入的研究;结果可促进对彭波半细毛羊产双羔性状及藏系绵羊繁育力的深入研究.（图4表1参21）
关键词： 彭波半细毛羊 绵羊产羔数 卵巢 定量蛋白质组学 差异表达蛋白
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