科研产出
黑斑原鮡肝脏与副肝代谢差异比较
《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）是我国雅鲁藏布江中上游江段特有鱼类,为适应雅鲁藏布江急流、低温的水域环境条件,进化出独特的组织器官——副肝。本研究采用组织学、生物化学以及转录组学的方法开展了黑斑原鮡主肝与副肝代谢差异调控机制的研究。结果表明,黑斑原鮡主、副肝脏在结构组成、肝细胞线粒体数量及线粒体蛋白质组成上无显著差异。转录组学结果表明,主、副肝脏共有差异表达基因77个。经GO功能注释,筛选出羟甲基戊二酸单酰CoA合成酶（Hmgcl）、血栓素合成酶（Tbxas）、钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Cask）、甲酰甘氨酸生成酶（Sumf1）、蛋白质酪氨酸激酶（Jak1）以及甘油酸激酶（Glxk）等差异表达基因,这些基因富集到氨基酸代谢、脂肪代谢等过程。KEGG通路富集结果显示,差异表达基因富集到丁酸盐代谢通路（butanoate metabolism）、过氧化物酶体（peroxisome）、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸降解（valine, leucine and isoleucine degradation）、赖氨酸降解（lysine degradation）、色氨酸代谢（tryptophan metabolism）以及代谢途径（metabolic pathways）等信号通路。选出4个差异表达基因进行实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测,结果显示qRT-PCR与转录组测序结果基本一致。综上所述,黑斑原鮡主、副肝脏存在氨基酸、脂肪酸及能量代谢差异,其代谢差异可能与Hmgcl、Ptk2b、Gba和Dnm1l等基因在主、副肝脏中的差异性表达有关（P<0.05）。本研究筛选出调节黑斑原鮡代谢差异的关键基因和信号通路,为揭示黑斑原鮡主、副肝脏代谢差异机制奠定了理论基础。
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斜纹夜蛾四龄幼虫暴食相关基因的鉴定和通路分析
《植物保护学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为绿色高效防治斜纹夜蛾Spodoptera litura,采用高通量测序技术对斜纹夜蛾暴食前期(3龄期)和暴食初始期(4龄期)进行转录组测序,筛选暴食前期和暴食初始期斜纹夜蛾差异基因,并对其高表达基因的代谢通路进行KEGG富集分析,随机选择缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解通路的5个关键基因对其表达量进行测定,以验证转录组测序结果的正确性。结果显示,从转录组数据中共拼接了17 045条unigenes,其中有876条是新发现的unigenes,16 625条unigenes有注释信息;5个基因的实时荧光定量PCR结果与转录组测序分析结果一致,表明转录组分析结果可信;在暴食初始期高表达的基因主要为血淋巴脂多糖结合蛋白基因,暴食初始期高表达基因富集度最大的通路主要为支链氨基酸代谢通路,其次是脂肪酸降解通路,表明暴食初始期斜纹夜蛾在增强其消化系统功能和营养吸收能力的同时,也加强了其能量代谢,为幼虫获取更多的食物提供动力。
关键词： 斜纹夜蛾 幼虫 暴食期 转录组测序 代谢通路 实时荧光定量PCR
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