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措勤紫绒山羊线粒体基因组全序列测定及分析

内蒙古农业大学学报(自然科学版) 2022

摘要:措勤紫绒山羊是中国优良的绒用地方山羊品种,从线粒体水平分析其与其他中国地方山羊品种之间的系统发育关系,对措勤紫绒山羊的种群分类和遗传资源保护具有重要意义。本研究利用全基因组随机测序技术和生物信息学软件对措勤紫绒山羊线粒体基因组进行获取、拼接与注释。结果发现措勤紫绒山羊线粒体基因组全长16 641 bp,主要由22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白编码基因和1个非编码控制区(D-loop区)4部分构成;基于线粒体基因组D-loop区序列构建8个地方山羊品种的系统进化树,发现措勤紫绒山羊与柴达木绒山羊的遗传距离最近,推测是由地理位置相近所导致的。本研究为措勤紫绒山羊的品种鉴定和系统发育关系提供了一定的数据支撑。

关键词: 山羊 线粒体基因组 D-loop 系统进化树

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